在癌症治疗的临床研究中，研究人员进行着一场激烈的讨论，而讨论的话题则是抗生素在治疗癌症中的作用。研究人员发现，微生物在癌症治疗效果以及癌症患者全身健康方面起着重要的作用。为了尽量避免在消灭恶性肿瘤的同时，对正常细胞造成伤害，研究人员研究出了免疫疗法。免疫疗法可以利用免疫系统的精准能力，对外来抗原进行优先反应（包含肿瘤抗原），同时可以获得持续性的临床效果。但是，在我们的体内存在着一种能够影响免疫疗法的重要因素，那就是微生物。在人类的肠道中，存在着大约种细菌，这些微生物可以对我们的免疫系统进行微调整。
微生物群可以以多种方式影响人类的健康。最近，它在癌症方面的重要性，变得越来越明显。在许多癌症中，免疫调节药物使癌症的治疗发生了革命性的变化。为了继续利用免疫疗法，我们必须了解肠道菌群如何影响宿主在癌症环境中的免疫力。化疗和放疗可能会导致肠道屏障的破坏，这可能会使细菌通过上皮细胞转移，这导致微生物对癌症患者健康的影响更明显。
在临床前的多个研究中发现,肠道菌群的组成是影响抗肿瘤免疫和治疗效果的重要因素。人类肠道中的共生细菌的组成与检查点封锁抗体anti-PD-L1治疗效果的强弱有很大的关系。例如，双歧杆菌可以有效提高,antiPD-L1在临床干预的潜力。在一项平行研究中发现，CTLA-4封锁是依赖于肠道微生物群的，其抗肿瘤的作用依赖于不同的拟杆菌物种。同样,cpg寡脱氧核苷酸免疫疗法和铂类化疗需要在肠道菌群的作用下才能发挥出最大作用，临床资料也指出微生物群治疗相关的毒性之间也存在着一定的联系。
在使用易普利姆玛治疗黑色素瘤患者时，通常患者会伴随着患肠炎的风险，而肠道中拟杆菌门的细菌可以减少肠炎的发生。鉴于微生物对癌症治疗的重要影响，目前研究人员正在评估把抗生素作为治疗癌症的药物的可行性。
从历史上看,抗菌素治疗是维持癌症患者的整体健康治疗和预防传染性并发症的关键药物。然而,这个先例导致其被滥用,进而产生负面影响。除了阻碍致病性细菌,抗生素也可以消耗土著微生物群落,而微生物是一种抗肿瘤免疫的主要因素。肿瘤学家治疗癌症患者时，也面临着巨大的挑战，这个挑战就是该如何去寻找一个平衡点，既能,预防、治疗感染同时也能避免反复感染的恶性循环,增加多重耐药,以及随后的广谱抗生素治疗导致肠道失调。细胞毒性化疗结合抗生素治疗可能导致黏膜屏障损伤，进而促使条件致病菌的扩散,破坏上皮细胞,导致感染。
抗生素的使用也增加了移植物抗宿主病(GVHD)的严重程度和小鼠和人类接受同种异体造血干细胞移植的死亡率。此外，据报道，针对革兰氏阳性菌的抗生素在动物模型中通过抑制致病pTH17细胞和记忆TH1细胞的反应(6)，导致抗环磷酰胺肿瘤的产生。对环磷酰胺和顺铂治疗的慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者的后续临床研究证实针对革兰氏阳性菌的抗生素治疗与较短的无进展生存率和总体生存率相关。
鉴于临床证据表明肠道共生微生物的巨大影响力，16SrDNA测序和宏基因组测序已经成为研究肠道微生物的重要手段。回顾性分析已经建立起了微生物群和临床结果之间的相关性,包括对治疗的反应和毒性。这些数据也可以用来预测治疗反应，设计更多的个性化方案来降低治疗相关地形和抗生素影响的风险。筛选得到的生物标记也可以用来作为病人合适的微生物群干预策略如粪便移植、益生元、益生菌。
尽管我们对微生物群的了解越来越多，但是在癌症微生物组的研究方面仍然存在重要问题。随着微生物组测序技术变得更容易获得和广泛采用，可重复样本收集，处理以及分析方法是得到好的结果的重要保证。肠道微生物的组成在健康人中是相对稳定的，而在癌症患者体内由于放疗、化疗的作用，微生物则可以很轻易的造成肠道稳态的变化。目前微生物学研究的绝大部分只琛ラ鑴傜礌浠锋牸澶ф鏄灏?鍖椾含鏈�濂界櫧鐧滈涓撴不鍖婚櫌
